主要學術職務有：能源與環境光催化國家重點實驗室主任，國家環境光催化工程技術研究中心主任，國務院學位委員會委員，中國工程院化工、冶金和材料學部常委，工程科技創新戰略研究院學術委員會委員，福建省科協副主席，國民核生化災害防護國家重點實驗室學術委員會主任，中國化學會常務理事等。

付賢智院士是我國光催化領域的知名學者，他針對光催化領域的重大科學與技術問題，在光催化劑的設計與制備、光催化反應機理、光催化反應動力學和光催化反應器設計等方面開展了系統深入的研究，研制出一系列新型、高效、可見光誘導的光催化劑，開發出提高光催化過程效率的多種新技術、新方法和新裝置，承擔并完成了國家高技術產業化示范工程項目，解決了光催化技術產業化實施的一系列關鍵技術問題，并將光催化技術應用成功地拓展到環保、建材、電力等領域，研制開發了多項光催化產品及其工業生產技術并實現了產業化，取得了顯著的社會經濟效益，為我國光催化技術進步和產業發展做出了貢獻。近年來，主持和完成了國家科技攻關重大項目、國家支撐計劃項目、國家973計劃課題、國家自然科學基金重點項目等40余項國家、省部級科研項目，申請和授權國家發明專利40余項，在國內外重要學術刊物上發表了研究論文300多篇，先后獲得國家科技進步獎二等獎1項，省部級科技進步一等獎4項。

1998年獲全國模范教師稱號，2001年被授予全國師德標兵，2003年獲全國留學人員成就獎，2005年被授予全國先進工作者，2007年當選中共十七大代表，2011年當選第九屆福建省委委員，2013年當選第十二屆全國人大代表，2016年當選第十屆福建省委委員。

1969年至1974年福建省古田縣插隊。1974年至1984年畢業于福州大學地礦系并留校任教。1984年至1990年英國倫敦大學帝國理工學院碩士、博士。1990年至1993年日本地球科學綜合研究所高級研究員。1993年至1999年日本衛星影像與測繪株式會社地球信息系統部主任研究員。其間，1999年1月當選國際歐亞科學院院士。2001年福建省“數字福建”專家委員會主任。1999年至2002年歷任福州大學地球信息科學與技術研究所所長、福建省空間信息工程研究中心主任、校長助理、副校長兼信息學院院長。

2000年11月至2011年4月歷任致公黨福建省委副主委、主委。2002年12月至2008年1月任福建省政協副主席。2003年8月至2008年5月兼任福建省科技廳廳長。2002年12月至2007年12月任致公黨中央副主席。2007年12月至2012年12月任致公黨中央常務副主席。2008年3月起任全國政協副秘書長，全國政協常委，全國政協經濟委員會副主任。2013年起任十二屆全國政協副主席，全國工商聯主席，中國民間商會會長。